Les programmes d’amélioration génétique s’inscrivent dans le cadre de la stratégie nationale du développement de l’élevage, ils visent les 4 espèces : bovine, ovine, caprine et cameline. Depuis sa création, l’OEP a été le principal maître d’œuvre de ces programmes :
L’identification national animale Le contrôle des performances La reproduction animale Les livrets généalogiques